Строение клетки эвгленовых отмечается некоторыми специфическими особенностями: хлоропласты, имеющие разнообразное строение, содержат хлорофилл такой же, как у высших растений; наряду с этим в фотосинтезе участвуют кератины и ксантофиллы. Однако в клетках эвгленовых есть еще один пигмент — астаксантин, который не принимает участия в процессе фотосинтеза. Он сосредоточен в центральной части клетки и не влияет на ее зеленую окраску. При резком повышении освещенности астаксантин перемещается в периферической части клетки и затеняет хлоропласты, окрашивая клетку в красный цвет. Биологический смысл этого явления заключается в регуляции интенсивности падающего на хлоропласт света. Питательные вещества — парами-лон — накапливаются в виде крупных зерен, так называемых парамиллий. В передней части клетки располагается красное пятно — стигма, которая выполняет роль светочувствительного органа. Ядро в клетке одно.
Эвгленовые водоросли обладают одной уникальной способностью — им свойственны все три типа питания: автотрофный, гетеротрофный (т. е. питаются готовыми органическими веществами) и голозойный. Последний свойствен видам, которые обладают способностью заглатывать частицы органического вещества и даже некоторые мелкие организмы, что сближает их с животными. У некоторых представителей эвгленовых отмечу, но смешанное питание. Виды, имеющие зеленые пигменты, способны к фотосинтезу.
Размножаются эвгленовые водоросли делением клетки пополам, случается это обычно вечером или рано утром. Иногда перед делением клетки становятся неподвижными, ослизняются, теряют жгутики и только после этого наступает процесс деления клеток. Однако почти все эвгленовые водоросли, за некоторым исключением, ведут в вегетативном состоянии подвижный образ, жизни.
Эвгленовые водоросли представлены в водоемах достаточно широко. У нас встречаются: эвглена зеленая, эвглена рыбоподобная, эвглена игольчатая, эвглена ост-рицевидная, лепоцинклис яйцевидный, мономорфина грушевидная, факус камбаловидный, факус трехкиле-вой, факус крылатый, факус длиннохвостый, факус крошечный, трахеломонас вольвоксовый, трахеломонас темно-зеленый, трахеломонас мелкощетинистый, трахеломонас хвостатый, трахеломонас вооруженный, колациум мелкопузырчатый и многие другие.
Эвгленовые водоросли имеют родственные связи с зелеными водорослями. Они произошли от фотосинте-зирующих жгутиковых ядерных (эукариотических) организмов, но дальше одноклеточных видов их эволюция не пошла.